Клуб основан в 1961 году. С этого года начал играть в чемпионате СССР, Класс «Б». В 1971, заняв второе место в группе, команда завоевала право выступать во второй лиге. Тюменский «Геолог» — чемпион РСФСР 1985, обладатель Кубка РСФСР 1984, финалист Кубка РСФСР1983 и 1985, победитель зональных турниров второй лиги 198419851986, второй призер1983.

1982, 14 августа открыт стадион "Спартак" на Царевом Городище, позже - "Геолог", теперь - стадион футбольного клуба "Тюмень"; начали строить в 1964 г.

После прихода на тренерский пост Валерия Овчинникова тюменский «Геолог» стал лидером своей зоны во второй лиге. Болельщиков привлекал лозунг клуба: «Главное — показывать красивую игру, а результат придёт сам». В 1986 тюменцы завоевали право играть в первой лиге союзного первенства, где провели пять сезонов — с 1987 по 1991. Лучший результат на этом этапе команда показала в 1989 и 1990 — 11-е место.

1986, 11 июля первый международный матч по футболу между тюменским "Геологом" и итальянским "Спортингом" из г. Ренонель-Эмилия; Тюменцы выиграли со счетом 2:1

В результате распада СССР и формирования нового чемпионата России тюменский клуб был включен в турнир высшей лиги, где играл в 1992199419951997 и 1998. Лучший результат — 12-е место (1994). Худший результат — 20-е место (1992). В 1993 и 1996 тюменцы выступали в первой лиге чемпионата России, оба раза становясь победителями турнира и завоёвывая право выступать на следующий год вновь в высшей лиге. В сезоне 1998 команда покинула высшую лигу, а спустя год, транзитом через первую, оказалась во второй лиге. Следующие сезоны тюменцы безуспешно пытались вернуться на прежние позиции. В 2003 команда «Тюмень» была расформирована и не принимала участия в первенстве России. На базе клуба продолжал выступление в турнире третьей лиги бывший дублирующий состав, усиленный несколькими игроками из основного состава распавшейся «Тюмени». Команда носила название «СДЮШОР-Сибнефтепровод».

В 2004 году клуб выиграл зональный турнир Любительской футбольной лиги, однако отказался от вступления в профессиональную лигу. На следующий год «Тюмень» повторила своё достижение, и клуб вернулся во второй дивизион. С 2006 года «Тюмень» возобновила членство в Профессиональной футбольной лиге. Накануне сезона 2008 клуб возглавил президент мини-футбольного клуба «Тюмень» Александр Валентинович Попов. Символика клуба была изменена. Цветами команды стали чёрно-белые. С 2011 в команде новый тренерский штаб: главный тренер - Сергей Иванович Никитин, старший тренер - Владимир Анатольевич Ушаков, тренер - Евгений Александрович Маслов, спортивный директор - Юрий Иванович Кудинов.