На протяжении пяти сезонов «Тюмени» не удавалось закончить сезон в верхней половине таблицы, сезон 2005/06 команда и вовсе завершила на последнем месте. Однако, сохранив место в Суперлиге, уже в следующем сезоне тюменцы сумели занять шестое место. Следующий сезон стал для них ещё успешнее — четвёртое место. 

Историческим для «Тюмени» стал сезон 2009/10. Вначале тюменцы впервые в истории вышли в финал кубка России по мини-футболу, а затем впервые выиграли медали чемпионата — и сразу серебро.

 Отчасти эти успехи были достигнуты благодаря привлечению бразильцев. В сборную бразильских легионеров, составленную для участия в «Кубке Финпромко» 2009 года, попало сразу четыре игрока тюменской команды — Греуто, Афранио, Шуша и Леандриньо. Первые три игрока принимали участие в завоевании клубом первого серебра в истории. По окончании сезона Шуша получил вызов в сборную Бразилии, а Афранио был признан лучшим игроком первенства. 

Однако у «Тюмени» есть и собственные сильные воспитанники. Ветеран команды Денис Абышев несколько лет подряд призывался в национальную сборную, в ее составе стал серебряным призером Чемпионата Европы 2005 года, а также завоевывал золотые и бронзовые награды чемпионата мира среди студентов. Победителем студенческого первенства становился и голкипер команды Георгий Замтарадзе. На чемпионате мира 2008 года играл молодой тюменец Николай Переверзев. В 2007 году «Тюмень» заявила в Высшую лигу свой фарм-клуб «Тобол-Тюмень-2», представляющий Тобольск, что позволило более эффективно работать с молодыми игроками, постепенно привлекая их к основному составу.